Sono i due importanti gas serra direttamente influenzati dalle attività umane. In funzione dei tempi di residenza in atmosfera, la CO2 è considerato un Long Lived Climate Forcers (LLCF) mentre il CH4 un Short Lived Climate Forcer (SLCF). Le osservazioni a Monte Cimone contribuiscono al programma GAW-WMO ed a ICOS – IntegratedCarbon Observation System, l’Infrastruttura Europea di riferimento per lo studio del carbonio. In particolari condizioni atmosferiche, le osservazioni eseguite a Monte Cimone sono potenzialmente in grado di caratterizzare le emissioni provenienti dal Nord Italia.Le misure di CO2 dell’AM iniziarono nel 1979 mentre quelle del CNR nel 2018.
Le misure di CH4 CNR e Università di Urbino iniziarono nel 2009, ed a partire dal 2015 anche il CAMM inizia questo tipo di misure.